弱井幸之助在新宿市中心的一条后巷经营一家小型精神病诊所。通过仔细聆听患者的心声、耐心面对患者的症状，弱井医生诊断出其他医生未能识别的疾病，给患者带来了希望。第一次在精神科工作的护士雨宫由里，通过不断观察弱井的工作，对精神科治疗愈发着迷。然而，雨宫并不知道弱井也有着悲惨的过去——

某处简陋公寓，发现一具数月前死亡的女性尸体。事后死者被屋中十几只饥饿的猫啃噬，惨不忍睹。经警方初步判定，这个名叫铃木阳子的女人系典型的孤独死，可是负责此案的女警官奥贯绫乃（小西真奈美饰）却有不同的看法、现场的蛛丝马迹显示，阳子之死另有隐情。镜头回溯，我们看到阳子（尾野真千子饰）跌宕黯淡的一生，她从小不受母亲待见，长大后独自前往东京发展，为了多卖一份保险饱受凌辱。后来，遇人不淑的阳子邂逅利用游民骗取生活补助的神代武（安田显饰），由此推开了通往地狱的大门。每走一步，阳子都是在绝望地和过去的自己决裂……本片根据叶真中显的同名小说改编。

在旅行的列车上，美雪（铃木杏 饰）再次邂逅了金田一（松本润 饰），并追随于他。同伴用手中的DV记录着发生的一切。某夜，一个木偶团长不幸被害。案发后，警探发现他原本在车厢里的尸体不翼而飞，于是引起了一阵骚乱。探长决定在一家酒店暂时住下，找寻犯罪嫌疑人，金田一等人也一同前往。后来，根据案情，嫌疑人被锁定在木偶团体成员之中，探长想通过体重以缩小搜查范围。但是，一个女成员的意外死亡，却让金田一发现了隐藏的秘密，并由此揭开了一桩尘封多年的旧案真相…… 本片根据天树征丸的漫画改编，除上述特别版魔术列车杀人事件外，还包括以下6个事件，分别为幽灵客船杀人事件、法兰西银币杀人事件、黑死蝶杀人事件、速水玲香诱拐杀人事件、魔术的森杀人事件和露西亚人形杀人事件。

「瓜を破る」の主人公は、30歳を超えて未だ性体験がないことをコンプレックスとしている会社員女性・まい子。ほかの人々が普通のことのようにしている体験を自分だけができていない現実に焦るまい子は、仕事中もプライベートの時間も、そのことが頭から離れなくなってしまう。そんな彼女が、コピー機のメンテナンス会社で働く男性・鍵谷と出会ったことから物語は動き出す。