善良正直的少年沉香与父亲刘彦昌一同生活在大山里，某日他被坏孩子辱骂是“没有妈妈的孩子”。沉香倍感伤心，于是向父亲追问母亲的下落。刘彦昌思索再三，向儿子讲述了当年的故事。原来，当年刘与仙女三圣公主相恋，结果惹来二郎神杨戬的忌恨，最终将自己的亲妹妹三圣公主压在莲花峰下。 　　得知一切的沉香决定寻找母亲，路上他遇见朝霞姑姑，进一步得知狠心舅舅杨戬陷害他们父子的始末。可是他年龄如此小，又无任何本领，如何与法术高强、阴险狡诈的杨戬抗衡？在朝霞姑姑的指引下，他拜在霹雳大仙的门下。为了救出困在莲花峰的母亲，沉香展开了艰苦的修行……

故事背景被安排在一个景色优美的由昆虫（蚂蚁）组成的世界，片中主角是一个聪明好学，敢于创新的少年，由于酷爱三十六计，被朋友们称为诸葛小亮，但在一次科学实验中，他和他的朋友突然变成了非常非常小的人，甚至和蚂蚁一样大，世界突然变得和从前不一样了，于是，机智的诸葛小亮开始了前所未有的历险。既然是历险就有很多想不到的事发生，《三十六计》是我们的小主角最有力的武器。