3000万年前，一股黑暗力量使世界陷入恐惧。最后是光之巨人将黑暗封印到了遥远的宇宙中。不过，光之巨人也用尽了自己的力量，在红色星球上陷入了长眠。 时光流转，地球和平同盟“TPU”在地球组建了精英小组“精英胜利队”。 主人公真中剑悟生活在新开拓的火星上，他有一个梦想，就是守护大家的笑容。剑悟平日里在植物研究中心工作，他是名植物学家。最近他总是重复做一个恶梦，梦里总出现一名神秘的巨人，这让他十分苦恼。

宇宙发生了异变，新的强敌出现！许多不该出现的凶恶怪兽和外星人纷纷出现！有人在偷偷谋划一场巨大的阴谋，如今，阴谋渐渐浮出水面。众多奥特战士们联手，前来解开谜团的真相。 第一章讲的是利布特奥特曼加入银河救援队之前的故事。利布特和麦克斯奥特曼一起，在某个行星上察觉到异样的气息，没想到那里居然是敌人故意留下的陷阱。为了保护利布特，麦克斯陷入危机。 第二章讲的是贝利亚年轻时候的故事。那时候贝利亚还在光之国，贝利亚和健的关系非常要好。后来因为嫉妒心作祟，贝利亚渐渐走向了不归路。 第三章讲的是泰迦等人击败格里姆德，泽塔奥特曼去地球之前的故事。当初三人小队与优幸分离后，泰迦和泰塔斯、风马在某个行星上努力修行，结果遭到了人工生命体恐魔人杰特的袭击。 这一切阴谋的背后与一位叫阿布索留特 塔尔塔洛斯的外星人脱不了关系，一场旷日持久的巨大阴谋终于附上了水面。