以成为神奇宝贝大师为目标，小智（松本梨香 配音）、小刚（うえだゆうじ 配音）和小霞（豊口めぐみ 配音）带着各自的神奇宝贝在世界各地进行艰苦的修业之旅，今天他们历经长途跋涉终于来到了风景秀美的米琪亚镇。在当地一对小兄妹的介绍下，小智一行前往神殿遗址游玩。谁知却遭遇了极其危险的情况。关键时刻，掌管时间的迪亚鲁加和守卫神殿的西娜（北乃きい 配音）、凯宾（岸祐二 配音）帮助了他们，能与神奇宝贝心灵沟通的西娜还熄灭了冥王龙的怒火。从西娜口中得知，创造了世界的神奇宝贝即将苏醒，它不仅会使时空扭曲错乱，还将为世界带来毁灭性的灾难…… 本片为神奇宝贝系列第十二部电影剧场版。

主角味吉阳一继承了父亲留下来的大众食堂，在机缘巧合下认识了厨师协会的统帅，人称「味皇」的村田源二郎，更被味皇选中担任味皇料理某部门的主任……接受各人各项的美味比赛……最后阳一又能否胜任？「肚子饿的时候，什么也做不来，不能应战，也不能画漫画。不管是你，还是我，大家都喜欢吃，但既然要吃，还是要挑好吃的。因此，请大家好好享受一下阳一所设计出来的满分料理吧！