动画片《马达加斯加》让观众认识了一群令人捧腹的动物，而其中最令人忍俊不禁的，绝对要属那几只企鹅了，根据这部动画电影改编的动画电视剧也已经拍摄已经到了第三季。第三部故事讲述了当Alex它们还在非洲度假时，企鹅们早已回到了纽约动物园，并且继续执行它们的秘密任务，并帮助动物园里的动物们。在动物园里，它们认识了一些朋友，而且在马达加斯加自称为王的狐猴Julien和它的“小跟班”Maurice和Mort也来到了动物园。

动画片《马达加斯加》让观众认识了一群令人捧腹的动物，而其中最令人忍俊不禁的，绝对要属那几只企鹅了，根据这部动画电影改编的动画电视剧也已经拍摄已经到了第二季。对多数人而言Skipper，Kowalski，Rico和Private只不过是四只住在中央公园动物园的可爱企鹅。这也正是他们希望留给别人的印象。为什么呢？因为这些看似平静温和的企鹅其实是一群有着无可匹敌的突击能力的精英力量。他们的使命是什么？维护动物园的秩序。他们的敌人又是何方神圣呢？令人讨厌的新邻居Julien自诩为狐猴王是动物园的新成员，妄图重整动物园的秩序，企鹅们必须为动物园首领的宝座与之展开争夺。

为了给最疼爱的小老弟菜鸟（克里斯多夫·奈茨 Christopher Knights 配音）庆生，老大（汤姆·麦格拉思 Tom McGrath 配音）带领菜鸟以及好搭档科斯基（克里斯·米勒 Chris Miller 配音）、瑞哥闯入了防守最严密的美国黄金储备中心，只为找到金库尽头仅有的那台销售炸薯条的自动贩卖机。谁知他们刚刚完成任务没多久，便被长着触角的贩卖机吞了进去，随后被运到一个神秘的所在。在全封闭的设施内，四只企鹅见到了伪装成基因遗传科学家的章鱼戴夫（约翰·马尔科维奇 John Malkovich 配音）。原来戴夫曾是动物园一只明星章鱼，但随着萌态十足的企鹅们的到来，他便跌入了绝望的深谷。因此戴夫潜心研制了可怕的血清，发誓要向所有他曾待过的动物园中的企鹅展开报复。 　　老大和伙伴们在逃亡途中得到北风特工队的救助，而他们和这些高傲的特工队员将分别阻止戴夫的阴谋……

很多年前，银河系另一端的两颗行星被黑洞所吞噬，两个尚在襁褓中的外星孩子乘坐飞行器来到地球。拥有超能力的他们在截然不同的环境中长大，也造就了各自不同的性格和人生走向。长大后，仪表堂堂、正气凌然的成为了保卫城市和平的城市超人（布莱德·彼特 配音），而相貌猥琐、蓝皮大头的则化身破坏人民安康的大坏蛋麦克迈（威尔·法瑞尔 配音）。他们终日争斗，战争不断。城市超人博物馆开幕当天，麦克迈成功越狱，并劫持了美丽的女主播罗珊。在天文台的终极决战中，麦克迈成功击败多年的老对手，完全统治了这座城市。好景不长，失去对手的麦克迈很快便觉得寡然无味。偶然间受到罗珊的启发，他决心创造出一个新的正义英雄，恢复当初此消彼长的快乐日子。只是，一切开始朝着不可预测的方向发展……